《機動戰(zhàn)士高達(dá)F91》的電影版于1991年3月16日上演，影片描寫0123年3月16日至3月30日“克洛斯邦·班卡多動”（Crossbone Vanguard）時期的故事。U.C.0123年3月16日，殖民衛(wèi)星FRONTIER SIDE遭到自稱C.V（死亡先鋒）的迷之MS部隊襲擊，造成FRONTIER Ⅳ的 500 多居民死亡、 14 萬人避難。 在避難的人群中有GUNDAM F91開發(fā)者之一梅凌·亞諾博士的一對子女西布頓（—ブック アノ—）、麗詩，以及羅拿家族的次女貝·羅拿，又名茜茜莉·費齊。羅拿家族是 C.V的領(lǐng)導(dǎo)者，提倡貴族主義并統(tǒng)一殖民衛(wèi)星、建立宇宙比倫空中花園。茜茜莉的親娜迪亞不滿于家族的束而和一名叫史奧·費爾齊下人私奔，當(dāng)她發(fā)現(xiàn)史奧劣的人格后又拋下自己的兒不知所蹤。當(dāng)西布頓等來到碼頭，在其父洛士?亞諾的帶領(lǐng)下登上小型穿機時，茜茜莉在其養(yǎng)父史的脅迫下，離開西布頓和己的哥哥度雷一起返回羅家。逃到FRONTIER Ⅰ的西布頓一行，遇到了噓邦軍的練習(xí)船艦“宇宙舟”。3月19日至22日，C.V開始進(jìn)攻FRONTIER Ⅱ、 Ⅲ并將其壓制。因為缺少人手，西頓他們被拉入聯(lián)邦軍幫忙也因此發(fā)現(xiàn)其母親開發(fā)的F91 亦在此方舟內(nèi)（采用了生物電腦的F91，事實上是專為NEW TYPE設(shè)計的）。 麗詩還替機械師解答了母親在F91生物電腦中留下的迷題， 這使得每啟動一次就會出故障F91終于被完成了， 又因“宇宙方舟”上只得比特一位駕駛員，故西布頓推上 F91的駕駛艙，他的NEW TYPE能力也開始漸漸地覺醒了。另一面，回到羅拿家的茜茜莉到祖父馬爾捷的熱烈歡迎并想讓她成為宇宙巴比倫中花園的女王。被祖父一剖白打動的茜茜莉剪去長打算留在羅拿家，并開始習(xí)駕駛MS，教她駕駛MS的查貝尼（C.V 中最強的“黑之部隊”隊長）亦現(xiàn)茜茜莉也是NEW TYPE。3月26日，C.V的最高指揮官鐵假面（茜莉的父親，原名卡羅素，妻子和別人私奔而戴上面遮丑，乃是強化人類）在FRONTIER Ⅳ發(fā)表宇宙巴比倫宣言。 而西布頓亦趁機潛入羅拿家的別墅欲帶走茜茜莉未果，反而累了自己的父親?；氐健?宙方舟”，和分別多時的親相遇，不免責(zé)怪其母拋他和麗詩埋頭于工作中。西布頓和他的母親盡釋前時，茜茜莉的母親娜迪亞逼著史奧帶她去見自己的兒，并要茜茜莉離開羅拿。不聽母親勸告的茜茜莉長而去，此時娜迪亞發(fā)現(xiàn)在她身后的史奧已被鐵假所殺，緊接著自己也被C.V的士兵抓了起來。3月30 日， 不知情的茜茜莉與查貝尼一起奉命佯攻FRONTIER Ⅰ，而鐵假面則帶著他的艦隊占領(lǐng)FRONTIER Ⅰ的能量供應(yīng)裝置替其秘密武器“巴”提供能源。查貝尼的部瑪安娜.布爾芝因嫉妒其上司對茜茜莉的過分關(guān)懷而戈，投奔“宇宙方舟”，西布頓等人一同迎擊C.V 的“黑之部隊”。當(dāng)安娜法家麗的MS被查貝尼擊中后，西布頓亦與茜茜莉的MS交鋒，所幸最后兩人認(rèn)出對方，茜茜莉回到西布頓身邊?！昂谥筷牎背吠?不久，鐵假面的母艦上便出大量“巴克”進(jìn)入衛(wèi)星?！鞍涂恕笔且环N專門用殺人的兵器，它能感應(yīng)人波長而上天入地將衛(wèi)星中居民全部殺死！西布頓、茜莉和比基特三人奮力抵“巴克”，卻沒有多大效，比基特當(dāng)場陣亡。西布和茜茜莉設(shè)法將“巴克”引到狹窄的通道中令其相，然后又炸毀了生產(chǎn)“巴”的船艦?；氐侥概炆系?貝尼，知曉鐵假面瞞著他總帥馬爾捷制造了“巴克并企圖以此將月球和地球居民全部抹殺之事后，立將鐵假面的副官處死，并余下的C.V部隊撤離FRONTIER Ⅰ。覺察到茜茜莉背叛的鐵假面惱羞怒，駕駛著最新的MA“拉夫烈西亞”追擊茜茜莉和布頓。戰(zhàn)斗初始， F91和茜茜莉駕駛的比維拿.基拿在拉夫烈西亞的強大力下毫無還手之力，比維拿.基拿被擊毀，茜茜莉被鐵面抓出駕駛艙拋向茫茫的宙。憤怒的西布頓發(fā)揮出F91 真正的力量，使出有質(zhì)量的殘像“分身”將鐵面打倒。戰(zhàn)斗結(jié)束后，及逃出FRONTIER Ⅰ的宇宙方舟緩緩駛向F91，查貝尼見宇宙方舟上搭著大量的難民，又目睹到布頓失魂落魄地四處尋找茜莉的樣子，便放過他們著自己的部下悄悄離去了西布頓在其母親的指點下運用NEWTYPE的感知能力， 終于找到了飄蕩在無盡空間中的茜茜莉，兩相擁在一起，其喜悅之情言而?