創建于1947年的北平私立惜陰中學是四十三中學的前身，創辦人王耀庭即惜陰中學第一任校長，由當時的社會名流和軍政要員，醫學科學專家組成了校董事會確立了“救濟失學青年，普及中等教育”的辦學宗旨。
1949年1月31日北平解放，人民政府接管了惜陰中學，成立了新一屆董事會，推舉張長序為第二任惜陰中學校長。
1952年9月23日，
北京市政府將惜陰中學收編為國有市立中學，并頒名為“北京市第四十三中學”，當時的彭真市長親自任命張長序為北京市第四十三中學校長，張世齡為教導主任。
當年的四十三中學雖然有了較大的改善，但辦學條件仍很艱苦，三幢平房教室，一座二層小樓，樓上是辦公室，樓下是教室，中間是一塊小操場。然而在黨的領導下全體師生員工，艱苦奮斗，白手起家，同心同德，共建家園，學校得到了飛快發展，教育教學質量飛速提高，學校98年被命名為“北京市藝術傳統?！?，學校在初中開設了聲樂、管樂和藝術特長班，為學校的藝術特長培養奠定了基礎，并結出了豐碩成果。
近年來學校引入科研機制，走科研興校之路，將科研的思想和方法滲透于教育、教學、管理之中。
學校堅持兩全的教學指導思想，堅持以教學為中心，堅持教育、教學過程的規范管理，創設了教育、教學的良好氛圍，走上了嚴謹治學的道路，形成了自己獨特的辦學風格。
